納米孔測序技術(shù)在腺病毒疫情中實(shí)時(shí)檢測應(yīng)用研究

編號(hào)：NMJS06945

篇名：納米孔測序技術(shù)在腺病毒疫情中實(shí)時(shí)檢測應(yīng)用研究

作者：李鵬 楊朗 林彥鋒 李沛翰 王凱英 楊超杰 賈雷立 邱少富 宋宏彬

關(guān)鍵詞： 7型腺病毒 納米孔測序技術(shù) 掌上測序儀

機(jī)構(gòu)： 中國人民解放軍疾病預(yù)防控制中心傳染病控制中心

摘要： 目的研究納米孔測序技術(shù)在2019年2月河北省某市一起腺病毒疫情檢測中的應(yīng)用情況,并對(duì)不同樣本處理結(jié)果進(jìn)行描述和分析。方法隨機(jī)選擇重癥、輕癥病例鼻咽拭子各16份,混合富集后通過MinION測序儀直接測序。采用實(shí)時(shí)熒光PCR方法檢測腺病毒,進(jìn)一步應(yīng)用MinION對(duì)Ct值最低的單個(gè)腺病毒陽性樣本進(jìn)行直接測序。結(jié)果8例重癥、15例輕癥病例熒光PCR檢測為腺病毒陽性。MinION測序分別在14min和22min檢測到混合樣本和單個(gè)樣本中7型腺病毒序列,兩者3h內(nèi)產(chǎn)生測序數(shù)據(jù)基本覆蓋腺病毒參考基因組。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)疫情毒株與北京一株毒株具有共同遺傳來源。結(jié)論納米孔測序技術(shù)可以快速檢測疫情感染腺病毒并獲得基因組序列,為MinION在新突發(fā)、未知或變異病原的檢測應(yīng)用提供了重要參考。